【甲申七月三十日願文】
歸命能仁無上尊。大孝大慈真法性。三乘權實眾威神。願賜哀憐垂攝受。弟子智旭。自惟夙障。纏此幻形。復以深愆。丁茲劫濁。三寫烏焉。悲佛法之衰亂。五逆橫作。痛國步之艱難。朝野無改過之心。緇素爭覆轍之踐。良由共識相種。惡業同牽。同分妄見。眚緣共起。徹底思惟。決無心外實境。由衷悔憾。須勤體內漚和。爰與同行。幷集檀那。普為國王帝主。父母親緣。土境萬民。法界含識。頂禮慈悲道場懺法。供養歴代知識道容。然香三炷。供常住三寶。又三炷。奉供幽冥教主。地藏慈尊。伏願大行皇帝。滅燬像之重尤。解殺戮之積怨。頓蒙解脫。速悟無生。今日主臣。進賢遠佞。發真實悲救兆民之心。捐利去名。竭真實不顧身家之悃。次願我等各各生身父母。歴劫親緣。師友知識。眷屬檀護等。已命過者。長辭八難。托質九蓮。今現在者。不受兵祲。永離驚慴。又願執勞運力助營福業者。一念無私。共轉國家之禍亂。三輪不昧。等消君父之愆亡。又願見聞隨喜。廣及法界眾生。普植良因。等成妙種。空五濁之幻染。證三德之性真。盡虛空界。悉悟圓常。智旭乃當。成等正覺。
【佛菩薩上座懺願文】
頂禮十方大威德。五分嚴身慈勇王。以不思議本誓願。同賜哀憐拔濟我。弟子智旭。敬然頂香三炷。供養十方法界。去來現在無窮無盡一切三寶。剖瀝肝心而自責曰。嗚呼。從古解超佛祖之前。行落凡庸之後。殆未有甚於罪旭者也。智旭。於未識佛時。未識法時。未識僧時。誤聽邪師。妄以千古理學自任。造無量謗三寶罪。應墮阿鼻大地獄中。具受阿僧祇劫劇苦。蒙觀音地藏二大士力。種種感觸。拔我邪心。令得歸向佛法。正信出家。不謂出家後。仍被夙業所障。僅發解慧。不沾法流。復因損己利人。遂致心欲定而反亂。念欲淨而偏染。二十餘年。略無實詣。今者反躬無似。內省多愆。念及生死事大。無常迅速。真堪慟地號天。追思剃染初心。離俗本志。何啻斷腸裂膽。外無化他之實。內妨自行之功。在世旣溺邪見濁流。出家又為法門汙道。進退失措。慚憾何窮。竊思向年力詬大士。大士尚自哀憐。今已深信三寶。三寶寕弗攝受。秖由無始障濃。自隔同體悲應。然障無實法。惟心所生。旣從心生。還從心滅。而理障必須理除。事障應須事遣。自惟多生以來。急乘緩戒。薄事尚理。久墮三塗。偶獲暫出。所以一聞宗教。徹底知歸。力學毘尼。偏多違犯。圓頓妙理。無精細而不入。相好觀門。雖少分而罔成。旣揣病源。理須良藥。曾聞造像功德。最能滅罪除愆。禮拜懺摩。實可洗心滌慮。爰發虔誠。集資改造一佛二菩薩像。仍發誓願。恒禮占察行法。不論年月。耑祈純善輪相。眾生雖垢重。諸佛不厭捨。必以大慈悲。哀愍度脫我。使我從今以後。心無掉舉。身得輕安。護口過而勿出綺語惡言。淨意地而不起襍思欲覺。速得清淨三輪。克臻自他二利。普化眾生。同生淨土。
【大悲行法道場願文（乙酉五月初三日）】
頂禮真實大悲心。究竟分證二覺者。我無始來墮虛妄。循環生死靡暫停。失本性樂枉受苦。今欲與拔自無力。願大威神同禮緣。不捨本誓垂哀濟。弟子智旭。自惟曠大劫來。言不顧行。口與心違。今雖幸厠緇流。仍不能忘故轍。簡點一生。有六大罪。而小過蓋無數焉。明知向上一路。而不能親到佛祖真受用處。明知圓頓教觀。而不能登五品以淨六根。明知大小毘尼。而不能清淨性遮諸業。明知殺業是刀兵劫因。而殺機尚未永忘。明知偷盜是饑饉劫因。而偷心尚未全斷。明知婬欲是疫病劫因。而婬機尚自熾然。是以別業資乎同分。現行感於共種。覩三災之洊臻。悲四生之無賴。徒懷曠濟之心。反受俱溺之害。捫心自憾。血淚何裨。今幸遇濟生禪院大悲心呪行法道場。發心隨眾熏修。願滌自他塵垢。適值母難之辰。敬然頂香六炷。供十方法界佛法僧寶。極樂教主阿彌陀佛。大悲心呪。總持祕要。千手千眼觀音大士。發六種願。一干戈永息。二五穀豐稔。三兆民正信三寶。四靈峰古剎復興。五六智旭多生惡習。速得尅除。煩惱脂消。功德圓滿。及永無意外逆順二緣。早完閱藏著述二願。又然臂香十炷。供十方三寶。發十種願。一期主淨障。二同行成器。三香燈侍者事理齊修。四外壇同行戒乘俱急。五常住一切職事執勞運力助緣營福者。不落有漏。六一切護法宰官捨財檀越。深悟解脫。七一切見聞隨喜。若緇若素遇影蒙塵。功無虛棄。永為道種。速證圓常。八靈峰住山沙門。及某等早得清淨輪相。圓成福慧二嚴。深念苦空。專求出要。九三塗息苦。八難超昇。蝡動蜎飛。均沾勝益。十以前功德。回向西方。普與含靈。同生淨土。
【禮千佛告文】
弟子智旭。與法界含識。自從無始至於今生。昧我法本空。起徧計情執。具迷事迷理二種無明。作分段變易二死根本。貪瞋癡慢。邪見紛紜。殺盜婬欺。飲啖顛倒。依於三業六根。廣造五逆十重。致使三塗鼎沸。八苦雲攢。乃至幸獲人身。仍遭劫濁。疾疫饑荒洊至。已足寒心。干戈兵革頻興。尤堪喪膽。父母妻孥莫保。骨肉身首分離。百骸潰散。誰思一性常靈。萬鬼聚號。肎信三緣自召。悠悠長夜。淚與血而俱枯。漠漠荒郊。魂與魄而奚泊。哀哉同體之痛。慘矣切膚之悲。憾道力未全。徒懷悽愴。思拯援無策。秖裂肺肝。爰鳩同志。五體投誠。代為大地被難眾生。頂禮三劫三千諸佛。臂然香炷。心發菩提。仰願大悲拔苦。大慈鑑機。大智慧光。爍群盲之積闇。大神通力。出苦海之沈淪。令今日海內海外。江北江南。已命過者。速脫九橫之城。徑超九蓮之土。未命過者。卽離驚竄之怖。永享太平之安。又願諸佛菩薩。興慈運悲。憫此劫波。來膺眾許。又願遇影蒙塵。蜎飛蝡動。廣及法界一切有情。從今已去。乃至菩提。常知警悟。不搆惡緣。永滅三塗。頓消八苦。卽同居而橫徹寂光。不僧祇而圓登妙覺。
【祖堂結大悲壇懺文】
頂禮大悲尊。及法界三寶。不厭垢眾生。始終垂哀拯。智旭。自惟無始來。至於今日。積惡逾於須彌。招苦浮於大地。雖蒙諸佛菩薩。種種提攜。薄解真乘。無柰夙業煩惱。淵淵深厚。時牽現行。葢無論未歸信前。厥罪無量。卽追思旣出家後。愆累尤多。如大悲行法道場。業五與勝會。乃襍亂障垢。終不與三昧相應。虛消檀信脂膏。辜負人天屬望。撫心扼腕。慚懼何窮。茲又恭遇幽棲禪寺。建清淨壇。施主竭供養之誠。期主極殷重之悃。智旭以下劣凡夫。沙門汙道。不惟叨陪法席。兼復謬主行儀。反躬無似。驚悚彌增。爰於方便結界之始。敬然臂香三炷。奉供大悲同體三寶。又三炷。供九位同行懺師。伏願同體三寶。憫智旭之沈淪。速垂拔濟。同行九人。憫智旭之不逮。咸賜匡扶。俾一期中。內障外擾以潛消。理觀事儀皆成就。智旭又於十方三世三寶前。現在同行九人前。胡跪合掌。剖肝瀝血。作如是白。智旭從無始來。至於前世。所有種種煩惱惡業苦報。無明覆故。已不自憶。今悉懺悔。願盡消除。智旭少年謗三寶業。今尚憶知。誠心懺悔。願盡消除。智旭出家已來。挂菩薩比丘虛名。不能如法行持。所有性遮諸罪。若憶不憶。無量無邊。今悉懺悔。願盡消除。智旭於四十六歲。自反多愧。退作但三歸人。勤禮千佛萬佛。及占察行法。幸蒙諸佛菩薩大慈大悲。於今年正月元旦。錫以清淨輪相。稍自慰安。無柰夙習根深。不能自拔。出壇後又起種種身口意業。乃至濟生菴修大悲行法。然香懺悔以後。默簡長夏初秋。仍復多諸違犯。嗚呼。佛稱二種健兒。一自不作罪。二作已能悔。夫作已能悔者。必悔已不更作。故可稱健兒也。數數悔。又數數犯。豈健兒乎。智旭。今猶墜厠人。身口耳鼻。皆陷糞中。獨明信因果。不謗大乘。清淨正眼。未沒溺耳。設諸佛菩薩。現前善友。不乘此時力拯拔之。正恐淹漬日久。清淨正眼。幷從淪隱。可不哀哉。智旭反覆自思。本以真實為生死心。決定大菩提心。絕不夾帶利名。亦不牽染恩愛如法出家。因地頗正。胡為墮落至此。久滯凡地。不預聖流。卽欲逃名晦迹。獨往深山。筋力漸衰。不堪行邁。且愛見慈悲。漫縈纏於婆和學侶。致使枉尋直尺。擔麻棄金。如此痛傷。惟諸佛菩薩能知。亦唯有諸佛菩薩能救耳。且向年力詆三寶。惟有罪障。諸佛菩薩尚自矜憐。今日宏通大乘。亦有微善。諸佛菩薩豈反終棄邪。是以披揭愚衷。仍求加被。願我煩惱脂消。功德肉肥。三學圓明。二嚴滿足。捨此幻軀。決生極樂。盡未來際。廣度群迷。又願同行九人。各各尅除習氣。成就總持。自利利他。棟梁法廈。又願期主福慧增長。檀越信行堅固。乃至隨喜緇素。執勞運力。見影聞聲。悉悟顯密圓通。咸了性修不二。直至菩提。不遭岐曲。又願風調雨順。物阜民安。干戈息而烽火無驚。疾疫除而醫藥無用。菽粟如水火。陌路猶至親。挽末劫頹風。不異正法住世。超娑婆濁惡。同歸安養蓮胎。
【占察行法願文（丙戌）】
歸命慈威無等尊。拔苦與樂真出要。定力能除三劫災。救世真士垂悲拯。弟子智旭。痛念劫濁難逃。刀兵競起。雖云同分妄見。實非無因誤招。往業莫追。來事可諫。爰偕同志某等（十人）各捐淨資。營修供養。三日方便。七日正修。如法結清淨壇。頂禮占察行法。六時行道。五悔鍊心。哀籲同體大悲。懇乞無緣拔濟。伏念眾生障垢。雖至重至深。三寶洪慈。終不厭不捨。苟一念知改過。必隨許以自新。况釋迦本師。勇猛稱最。地藏大士。誓願無忘。子幼弱父愛偏强。兒不肖母憐益甚。憫茲匍匐入井之愚。賜以身手衣裓之用。俾毫光照處。消兵戈為瑞日祥雲。法雨霑時。轉邪蘖為道芽靈種。所願風調雨順。國泰民安。正教流通。魔邪竄絕。次祈比丘智旭。身無病苦。心脫結纏。定與慧而等持。戒並乘而悉淨。期主某法社雖復三年。攝護願如一日。某等各各真為生死。發菩提心。尅除習氣。臻修法門。三學圓成。二嚴克備。續佛慧命。普利人天。又祈外壇隨喜緇素。悟知一實。開顯三因。二觀圓修。三忍圓證。又祈外護助緣。廣及法界含識。若見若聞。若不聞見。等植良因。均霑勝益。又祈江北江南。乃至震旦域內。近日遭兵難者。種種債負消除。一一怨嫌解釋。脫幽冥之劇苦。胎蓮蕚以超昇。恭干法界三寶。地藏聖師。真實證知。真實攝受。
【大悲壇前願文】
歸命頂禮十方常住三寶。大悲觀世音菩薩。地藏菩薩摩訶薩。伏祈同賜哀憐。俯垂拔濟。切惟智旭。向於九華拈得閱藏著述一鬮。遂復安心。重理筆硯。適於祖堂輪現。所患命盡之語。理應併意。徑馳樂邦。獨可痛者。閱藏未完。則私願未滿。教觀無繼。則法輪無傳。且梵網佛頂。雖已竭一隙之明。如塵培嶽。而棱伽唯識。猶復錮繁言之障。如霧迷空。自非假我數年。何以了茲陳債。自非洪慈庇護。安能不擾他緣。敬然臂香十炷。供養十方慈父。大悲觀音。地藏本尊。法界三寶。伏願智旭。從今以去。永離違緣。決定閱完大藏。得成閱藏知津。法海觀瀾二書。決能撰述成唯識論觀心法要。及相宗八要直解決能解釋稜伽尊經。乃占察十輪度世要典。決能闡明無量壽會。彌陀賢護。淨土津梁。決能發暢大般涅槃。扶律談常。最後垂範。又願學侶。乃至現在未來諸有志者。決能戒根永淨。福慧圓成。壽命延長。解行雙到。又願智旭。煩惱冰鎔。智慧火熾。十惡根枯。六情性露。又願萬民無三災之苦。四姓伐邪見之林。又願以此功德。普施法界眾生。臨命終時。決定得生阿彌陀佛極樂世界。親承供養大悲觀音。得無量無邊三昧神通。總持智慧。同地藏慈尊。普入法界諸大地獄。救度一切苦惱眾生。乃至分形散體。橫徧豎窮。十界現身。三輪施化。如一眾生未成佛。終不於此取泥洹。
【閱藏畢願文（甲午九月初一日）】
敬禮無邊際。去來現在佛。等空不動智。救世大悲尊。弟子智旭。敬然臂香四炷。供養盡十方三世一切諸佛。一切尊法。一切菩薩。一切聖賢。痛念智旭。年三十幻寓龍居。第二閱律。遂復發心徧閱大藏。於一夏中。僅閱千卷。旋以事阻。至三十三歲。甫進靈峰。結冬時山中無藏。癸酉春藏至未裝。丙子季春遁迹九華。於彼抱病。閱千餘卷。壬午山中藏裝成。癸未結制。簡閱僅千餘卷。又被他緣所牽。幻寓祖堂。及石城北。共閱二千餘卷。己丑歸山。因註法華占察二經。改治律要。未遑展閱。壬辰秋。擬進山畢茲夙願。又值幻緣牽至長水。借閱千卷。直至今甲午春。方獲歸臥林泉。又以一夏病緣居半。乃於仲秋月畢。僅獲完滿。竊計發心看藏。已經二十七年。出入茲山。亦匝二十三載。凡歴龍居。九華。漳州。泉州。祖堂。石城。長水。靈峰八處。方獲竣事。於中前後閱律三遍。大乘經兩遍。小乘經及大小論。兩土撰述。各止一遍而已。嗚呼。緬想法緣不易。可勝涕泗滂沱。今幸仗三寶力。已畢微願。是以然香更求加被。一者竊見南北兩藏。並皆糢糊失次。或半滿不辨。或經論互名。或真偽不分。或巧拙無別。雖有宋朝法寶標目。明朝彚目義門。並未盡美盡善。今輒不揣。謬述閱藏知津。法海觀瀾二書。儻不背佛旨。乞得成就流通。二者如圓覺維摩彌陀地藏。乃至大涅槃經。夙有微願。再加解釋。幷僧史寶訓。亦願增修。仰求庇護。令得速成。三者大殿半傾。前殿盡倒。觸目傷心。實難為力。今以付與天龍。願蚤成就。四者念此荒野之地。久不聞佛法名。實賴大檝法主。大粹靜主。大頎期主。以創其端。至於請藏。則戒周首發大心。道晉如源等。助成其美。印刷則受籌之功。裝潢則心見之力。苦守不墜。則成瓊為最。助緣成就。則善信是資。伏願已上過去者。以今然香功德。三障頓消。四生永脫。蓮開上品之華。佛授一生之記。現在者道心堅固。福德增長。壽命延長。智慧開發。又願學人。（六人）及堂內堂外上下靜室一切法眷。各各尅除習氣。趣向菩提。戒定慧以增明。福壽康而如意。又願智旭。從今以去。病苦消除。煩惱冰釋。不遭逆順兩魔。恒得安心著述。以茲法施功德。回向西方淨土。普與法界眾生。同生極樂世界。
【大病中啟建淨社願文（十二月十三日）】
甲午十二月十有三日。菩薩戒弟子智旭。一心歸命極樂世界阿彌陀佛。觀世音大勢至清淨海眾。及十方三世一切三寶。痛念智旭。本為生死大事。二十四歲出家。絕無半點好為人師之念。不意幻緣所逼。謬為人師。二十餘年。雖有弘法微善。而虛名所累。觀行荒疎。弗能折伏煩惱。以登五品。今病患纏身。心雖明瞭。力不自由。痛哭號呼。罔知攸措。幸仗佛慈。殘喘未絕。設非急勗淨業。何以永脫苦輪。爰發虔心。敬就靈峰藏堂。邀同志法侶。（十人）及外護菩薩沙彌。（五人）和合一心。結社三載。每日三時課誦。稱禮洪名。二時止靜。研窮大藏。教觀雙修。戒乘俱急。願與法界眾生。決定同生極樂。智旭從今以去。誓不登座說法。除同志執經問義不敢倦荅。若敷文演義。自有照南靈晟性旦。略可宣傳。誓不背佛平坐。除稍偏及對像坐。誓不登壇授戒。若授戒學律。自有照南等慈可以教授。誓不應在家人請齋。除寺院靜室中。仰乞三寶證明攝受。令智旭諸緣未盡。早就輕安。大限難逃。徑歸安養。生則念佛兼著述。死則不墮亦不退。又願同行法侶。無論旭存與否。堅志同修。有始有卒。又願外護沙彌。無論旭存與否。誠心營事。勿懈勿失。以此殊勝淨因。回向無上極果。普與含生。咸歸祕藏。
靈峰蕅益大師宗論卷第一之四